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Liste floristique des indices biologiques basés sur les diatomées - Observatoire Sélune
Les communautés microbiennes jouent un rôle majeur dans le fonctionnement des écosystèmes : elles sont à la base de la chaîne alimentaire (production primaire) et participent à la dégradation de la matière organique. Ces communautés sont, de plus, connues pour répondre rapidement à des changements environnementaux. Elles peuvent être utilisées comme indicateurs écologiques, à l'instar des macro-invertébrés.
Les diatomées benthiques sont les organismes photosynthétiques majoritaires au sein de cette communauté biologique. L’abondance relative des différentes espèces permet de calculer un indice de qualité du milieu (IBD). Des fortes différences de communautés entre les zones amont et aval ont été constatés quand les barrages étant en place. Elles seront amenées à évoluer après l’effacement de ces barrages.
Dans le cadre de l'observatoire Sélune ont été disposées des stations pilotes le long du cours principal de la Sélune, réparties de l’amont à l’aval des barrages hydroélectriques. Trois stations se situent dans les anciennes retenues des barrages, les deux autres, dites de référence, sont hors zone d'influence des anciens barrages (l'une étant en aval et l'autre en amont). Dans ces stations, les biocénoses aquatiques (incluant macroinvertébrés benthiques, biofilms, macrophytes...) sont suivies. Depuis septembre 2014, les stations sont idéalement échantillonnées tous les mois d’Avril à Octobre (7 relevés annuels) à l'aide de substrats artificiels (lames de verre disposées dans l'eau). En plus du relevé des diatomées (liste floristique, calcul de l'IBD), la concentration en chlorophylle-a est mesurée.
Lors de chaque campagne, un protocole d'échantillonnage expérimental INRAe est mis en oeuvre. Ce protocole implique des dispositifs d'immersion (1 mois) de lames de verre, une mesure in situ de concentration en chlorophylle-a via BentoTorch puis une récolte du biofilm sur ces lames de verre. Le biofilm est conditionné dans (1) dans de l'éthanol à 99.9% pour la détermination des IBDs et des listes floristiques (prestation externalisée, s'appuyant sur la norme NF T90-354) et (2) dans de l'eau minérale pour mesure de concentration de la chlorophylle-a via spectromètre.
La détermination des taxons s'appuie sur la version v17 de la référence TAXREF.
Le jeu de données est actuellement sous embargo.
Simple
- Date (Création)
- 2025-03-04T16:00:00
- Edition
-
2025
- Identificateur
- fr-20250303103810-umrsas-selune-v_bioc_biofilm_ind_biofilm
- But
-
Cette couche donne les listes floristiques ayant permis d'obtenir les indices biotiques IBD et IBD normalisés (EQR).
- Etat
- Planifié
- Contact pour la ressource
-
Nom de l'organisation Nom de la personne Adresse e-mail Rôle INRAE DECOD
Jean-Marc Roussel
Point de contact INRAE DECOD
Gorzérino Caroline
Point de contact AESN
funder Université de Rennes
Pannard Alexandrine
Point de contact INRAE U3E
Nadine Herrard
Gestionnaire
- Fréquence de mise à jour
- Lorsque nécessaire
- Remarque sur la mise à jour
-
Dernière mise à jour : 05/03/2024 avec les données de l'automne 2024
- Thème
-
-
Données ouvertes
-
- Thème
-
-
Limite
-
-
Thèmes INSPIRE
-
-
Installations de suivi environnemental
-
Environnement
-
-
GEMET
-
-
biologie
-
environnement
-
faune
-
- Limitation d'utilisation
-
Usage libre sous réserve des mentions obligatoires sur tout document de diffusion : "Source : INRAE - U3E"
- Limitation d'utilisation
-
Licence ouverte : https://www.etalab.gouv.fr/licence-ouverte-open-licence
- Contraintes d'accès
- Restreint
- Contraintes d'utilisation
- Restreint
- Autres contraintes
-
Jeu de données actuellement sous embargo
- Type de représentation spatiale
- Vecteur
- Dénominateur de l'échelle
- 25000
- Langue de la ressource
-
fre
- Catégorie ISO
-
- Environnement
- Localisation
))
- Date de début
- 2014-01-01
- Date de fin
- 2027-12-31
- Nom du système de référence
- RGF93 / Lambert-93 (EPSG:2154)
- Type de géométries des objets
- Point
Distributeur
- Contact
-
Nom de l'organisation Nom de la personne Adresse e-mail Rôle UMR 1069 SAS INRA - Agrocampus Ouest
Pole GéoSAS
Distributeur
- Format du distributeur
-
Nom Version ESRI Shapefile
1.0
Options de transfert numérique
- Ressource en ligne
-
Protocole Adresse Internet Nom WWW:LINK-1.0-http--link
https://programme-selune.com/fr/observatoire/ Observatoire Sélune
WWW:LINK-1.0-http--link
https://norminfo.afnor.org/norme/nf-t90-354/qualite-de-leau-echantillonnage-traitement-et-analyse-de-diatomees-benthiques-en-cours-deau-et-canaux/95749 Qualité de l'eau - Échantillonnage, traitement et analyse de diatomées benthiques en cours d'eau et canaux NF T90-354
OGC:WMS
https://geosas.fr/geoserver/selune/ows?service=WMS v_bioc_biofilm_ind_biofilm
OGC:WFS
https://geosas.fr/geoserver/selune/ows?service=WFS selune:v_bioc_biofilm_ind_biofilm
WWW:DOWNLOAD-1.0-http--download
https://geosas.fr/geoserver/selune/ows?service=WFS&version=1.0.0&request=GetFeature&typeName=selune%3Av_bioc_biofilm_ind_biofilm&outputFormat=application%2Fjson Télécharger "Listes floristiques des indices biologiques basés sur les diatomées - Observatoire Sélune" au format JSON
WWW:DOWNLOAD-1.0-http--download
https://geosas.fr/geoserver/selune/ows?service=WFS&version=1.0.0&request=GetFeature&typeName=selune%3Av_bioc_biofilm_ind_biofilm&outputFormat=csv Télécharger "Listes floristiques des indices biologiques basés sur les diatomées - Observatoire Sélune" au format CSV
WWW:DOWNLOAD-1.0-http--download
https://geosas.fr/geoserver/selune/ows?service=WFS&version=1.0.0&request=GetFeature&typeName=selune%3Av_bioc_biofilm_ind_biofilm&outputFormat=SHAPE-ZIP Télécharger "Listes floristiques des indices biologiques basés sur les diatomées - Observatoire Sélune" au format shapefile
Options de transfert numérique
- Niveau
- Jeu de données
Résultat de conformité
- Spécification
-
INSPIRE Data Specification for the spatial data theme Elevation
- Date (Publication)
- 2013-12-10
- Explication
-
Non Evalué
- Degré de conformité
- Non
- Généralités sur la provenance
-
Listes floristiques et abondances obtenues suivant la norme NF T90-354 (Novembre 2021).
La liste des champs présentés dans ce jeu de données est précisé dans le catalogue associé.
Métadonnées
- Identifiant de la fiche
- 0b477872-ce4c-4c21-8788-48f03912f05a XML
- Langue
-
fre
- Jeu de caractères
- Utf8
- Identifiant de la fiche de métadonnées parent
-
e91b4cb1-252d-4ae9-bdf4-24366af7a87c
e91b4cb1-252d-4ae9-bdf4-24366af7a87c
- Type de ressource
- Jeu de données
- Date des métadonnées
- 2025-11-06T16:23:31
- Nom du standard de métadonnées
-
ISO 19115
- Version du standard de métadonnées
-
1.0
- Contact
-
Nom de l'organisation Nom de la personne Adresse e-mail Rôle UMR 1069 SAS INRA - Agrocampus Ouest
GéoSAS
Point de contact
- Autre langue
-
LanguageCode CharacterEncoding Anglais Français Utf8
)))
